InnoDB は、トランザクションのデッドロックを自動的に検出し、そのトランザクションをロールバックしてデッドロックを回避します。バージョン 4.0.5 より、InnoDB は小さいほうのトランザクションを選択してロールバックするようになります。トランザクションのサイズは、挿入、更新、または削除したレコードの数によって決定されます。 4.0.5 より前のバージョンの InnoDB では、デッドロックを引き起こすロックを要求したトランザクションを、常にロールバックしていました。

InnoDB は、MySQL の LOCK TABLES ステートメントが設定したロックが関係するデッドロック、または InnoDB 以外のストレージエンジンで設定されたロックが関係するデッドロックを検出できません。これらの状況は、my.cnf で設定する innodb_lock_wait_timeout を使って解決する必要があります。

InnoDB がトランザクションの完全なロールバックを実行すると、そのトランザクションのすべてのロックが解除されます。ところが、エラーのために単一の SQL ステートメントのみがロールバックされると、SQL が設定したロックの一部が保持される場合があります。これは、InnoDB が使用する行ロックの格納形式では、ロックを設定した SQL ステートメントを後から特定できないためです。